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在WSL里用源码包安装openfoam失败

  • .J.

    所有依赖库都安装完毕

    0_1514382278815_57f3c941-c944-4357-9068-f87bb71d9842-image.png

    在~/.bashrc末尾添加了

    0_1514382496762_3e72860e-6f29-48bb-8f6d-f3f7f1fbd152-image.png

    错误信息为：

    ywj123450@DESKTOP-7HCQCPV:/mnt/f/OpenFOAM-5.x$ source ~/.bashrc
ywj123450@DESKTOP-7HCQCPV:/mnt/f/OpenFOAM-5.x$ ./Allwmake
Allwmake /mnt/f/OpenFOAM-5.x
make: Nothing to be done for `all'.

========================================
Start ThirdParty Allwmake
========================================

========================================
Build MPI libraries if required

========================================
Build Scotch decomposition library scotch_6.0.3
    /mnt/f/ThirdParty-5.x/platforms/linux64GccDPInt32/scotch_6.0.3
    scotch header in /mnt/f/ThirdParty-5.x/platforms/linux64GccDPInt32/scotch_6.0.3/include
    scotch libs   in /mnt/f/ThirdParty-5.x/platforms/linux64GccDPInt32/lib

========================================
Build PTScotch decomposition library scotch_6.0.3 (uses MPI)
    /mnt/f/ThirdParty-5.x/platforms/linux64GccDPInt32/scotch_6.0.3

    ptscotch header in /mnt/f/ThirdParty-5.x/platforms/linux64GccDPInt32/scotch_6.0.3/include/openmpi-system
    ptscotch libs   in /mnt/f/ThirdParty-5.x/platforms/linux64GccDPInt32/lib/openmpi-system

========================================
Build Metis decomposition
    optional component Metis was not found
========================================
Build CGAL
    optional component was not found

========================================
Done ThirdParty Allwmake
========================================

Allwmake src
no git description found
Allwmake src/Pstream
wmake dummy
wclean mpi
wmake mpi
....省略中间部分（这部分应该没问题）...
UPstream.C: In static member function ‘static bool Foam::UPstream::finishedRequest(Foam::label)’:
/usr/lib/openmpi/include/mpi.h:632:43: warning: use of old-style cast [-Wold-style-cast]
 #define MPI_STATUS_IGNORE ((MPI_Status *) 0)
                                           ^
UPstream.C:787:9: note: in expansion of macro ‘MPI_STATUS_IGNORE’
         MPI_STATUS_IGNORE
         ^
g++ -std=c++11 -m64 -Dlinux64 -DWM_ARCH_OPTION=64 -DWM_DP -DWM_LABEL_SIZE=32 -Wall -Wextra -Wold-style-cast -Wnon-virtual-dtor -Wno-unused-parameter -Wno-invalid-offsetof -O3  -DNoRepository -ftemplate-depth-100 -DOMPI_SKIP_MPICXX -I/usr/lib/openmpi/include -I/usr/lib/openmpi/include/openmpi -pthread -IlnInclude -I. -I/mnt/f/OpenFOAM-5.x/src/OpenFOAM/lnInclude -I/mnt/f/OpenFOAM-5.x/src/OSspecific/POSIX/lnInclude   -fPIC -shared -Xlinker --add-needed -Xlinker --no-as-needed /mnt/f/OpenFOAM-5.x/platforms/linux64GccDPInt32OptSYSTEMOPENMPI/src/Pstream/mpi/UOPwrite.o /mnt/f/OpenFOAM-5.x/platforms/linux64GccDPInt32OptSYSTEMOPENMPI/src/Pstream/mpi/UIPread.o /mnt/f/OpenFOAM-5.x/platforms/linux64GccDPInt32OptSYSTEMOPENMPI/src/Pstream/mpi/UPstream.o /mnt/f/OpenFOAM-5.x/platforms/linux64GccDPInt32OptSYSTEMOPENMPI/src/Pstream/mpi/PstreamGlobals.o -L/mnt/f/OpenFOAM-5.x/platforms/linux64GccDPInt32OptSYSTEMOPENMPI/lib \
            -pthread -L/usr//lib -L/usr/lib/openmpi/lib -lmpi -ldl -lhwloc  -o /mnt/f/OpenFOAM-5.x/platforms/linux64GccDPInt32Opt/lib/openmpi-system/libPstream.so
touch: setting times of ‘/mnt/f/OpenFOAM-5.x/platforms/linux64GccDPInt32OptSYSTEMOPENMPI/src/Pstream/mpi/using:openmpi-system’: No such file or directory

    求助大家！感谢！

  • 李东岳
    管理员

    Wsl是什么？

    .J. 1 Reply
  • .J.

    @李东岳 就是win10下的bash

  • 李东岳
    管理员

    没看到错误啊？

    .J. 1 Reply
  • .J.

    @李东岳 但是blockMesh命令找不到

    ywj123450@DESKTOP-7HCQCPV:/mnt/f/BaiduYunDownload$ blockMesh
blockMesh: command not found

    我看编译信息最后有一段

    touch: setting times of ‘/mnt/f/OpenFOAM-5.x/platforms/linux64GccDPInt32OptSYSTEMOPENMPI/src/Pstream/mpi/using:openmpi-system’: No such file or directory

    是不是代表缺少文件啊？

  • 李东岳
    管理员

    你openfoam编译完了么，一楼那个log不全

    .J. 1 Reply
  • .J.

    @李东岳 又试了下，用命令安装成功了，源码包直接编译有问题。
    不过又有个新问题paraFoam这个命令运行的时候说无法连接到x server

    Created temporary 'cavity.OpenFOAM'
paraview: cannot connect to X server

    x server是啥东西？

  • 李东岳
    管理员

    你直接下崽pataview win版本，直接用啊，用paraview win直接打开xxx.foam文件

  • bestucan
    版主 副教授

    x server 是linux的图形界面服务。不同于windows的图形界面嵌入到系统中，linux的图形界面对于系统而言是个可有可无的软件。win10自带的linux系统没有图形界面。

  • 李东岳
    管理员

    楼上说的很到位。

  • bestucan
    版主 副教授

    两个系统互相读文件就两种错误。

    • 换行ASCII码不一样，windows系统用“回车”+“换行”表示光标到下一行首部。linux和mac，一个用“回车”，一个用“换行”，表示光标到下一行首部。（忘了哪个用回车那个用换行了）
      所以linux的文件在windows里是一整行，不会换行。windows的文件在linux能换行，每行末会多个ASCII码。

    • 编码不一样，一般linux默认utf8编码，windows默认gbk编码。所以互相读取会有乱码。

    比较专业的编辑器应该都能解决这俩个问题。我用的emacs。

    • revert-buffer-with-coding-system 能用任意编码换行格式显示文件
      0_1515151005149_linux.png

    • universal-coding-system-argument 能用任意编码换行格式储存文件
      0_1515151017442_linux2.png

    那个文章里说不能在windows里编辑linux的文件，因为windows软件，比如记事本，的保存格式（换行ASCII码，文件结尾ASCII码之类的）不一样，在windows里用emacs编辑保存就没事。

    详细配色可以在.bashrc里修改，不过太繁琐，用户名浅色，文件夹深色，所以，选个中间色当背景
    0_1515151750116_Capture.PNG
    screen text 第五种颜色（暗红），和debian的主题色挺接近
    screen background 第八种颜色（浅灰）

    对颜色没兴趣的可以mv ~/.bashrc ~/.bashrc_backup; touch ~/.bashrc.
    再重新登录，所有的彩色都消失。不过要在新的bashrc里输入一些常用快捷命令alias ll='ls -alF'啥的。
    或者到.bashrc里搜索color，带color的代码块都#注释掉。

    --------------------------------------------------------分割线----------------------------------------------

    那个错误前前后后看都是openmpi的问题。openfoam文件夹下的bashrc默认使用系统的openmpi。git源里指引的教程在编译完第三方软件后，要wmRefresh一下，更新环境变量就是哉source一次那个bashrc，指向如果有现编的用现编的第三方软件。

    你的命令记录里应该是自己编译了openmpi的，可能中间缺个刷新环境变量的命令？
    openfoam5挺新的刚发布。windows自带的ubuntu版本是14的，可能14版的源最新的openmpi对于openfoam5不够新。自己编译的又没用上，最后一条g++还在调用/usr/lib/openmpi

    /usr/lib/openmpi/include/mpi.h:632:43: warning: use of old-style cast [-Wold-style-cast]

    这不就是说系统的openmpi有点老么:confused: 然后后面就忽略忽略（IGNORE）的，略死了。。。我猜是这样:confused:

    R 1 Reply
  • 李东岳
    管理员

    @bestucan

    专业，你主要用windows玩？我一直想换windows，但有些小细节总是不好处理，就比如那个界面颜色问题，按照网上说的颜色好了点，但是每次重新打开都要改字体。

    你模拟什么的，气溶胶？aerosol？

    bestucan W 2 Replies
  • bestucan
    版主 副教授

    @李东岳 控制理论与控制工程专业:lol: ，不过导师是流体力学方向的。主要用linux，因为大学就开始用linux做主力操作系统，同时又经常帮人处理windows问题，所以两个都挺熟悉。
    刚研一，课业重，还没开始模拟:sad: ，openfoam就看了四五个自带算例视频。。。
    气溶胶是我导师的实验室的名字。

    那个字体，对窗口点右键，最下面是属性（properties），倒数第二个就是默认（defaults），属性只改当前的，把默认里的设置改了就行了。

    李东岳 1 Reply
  • W
    教授

    @李东岳 在 在WSL里用源码包安装openfoam失败 中说：

    每次重新打开都要改字体。

    字体的问题。下载这个字体安装，然后把bash设为这个字体就好了。

  • 李东岳
    管理员

    回国的时候，我彻底的用bash一个星期试试，看看能不能习惯。Windows怎么都拜托不了。虚拟机的话需要个大的SSD太贵。真系统的话还得装个Windows虚拟机。:big_mouth:

  • 李东岳
    管理员

    @bestucan 在 在WSL里用源码包安装openfoam失败 中说：

    控制理论与控制工程专业 :lol:

    笑的很给力..

    bestucan 1 Reply
  • bestucan
    版主 副教授

    @李东岳 笑自己，明明考的本专业，学起来比跨专业的都带劲，表情包没有笑哭的头像，差评:upset:

  • R
    副教授

    @bestucan

    居然同时用 emacs 和 vim :angry: :angry: :angry: :angry:

    bestucan 1 Reply
  • bestucan
    版主 副教授

    @random_ran 生活所迫，生活所迫:sad: :sad: :sad: :sad:

    R 1 Reply
  • 李东岳
    管理员

    回国的时候，我彻底的用bash一个星期试试，看看能不能习惯。Windows怎么都拜托不了。虚拟机的话需要个大的SSD太贵。真系统的话还得装个Windows虚拟机。

    还是换回了虚拟机。bash用不习惯。买了个250的SSD，虽然还是觉得小，500GSSD有点贵了。

    另一种是装Ubuntu真系统，但是这个OFFICE一直用不了不知道咋处理，在国内OFFICE还是脱离不了啊。

    bestucan 1 Reply
  • bestucan
    版主 副教授

    @李东岳 bash用不惯可以试试fish和zsh（oh-my-zsh）。我是在虚拟机（virtualbox）里装了个win7然后qq、office都在里面。linux的家目录挂载成win7的一个盘；用的机械硬盘，速度还是可以接受的。把不用的更新和服务、动画效果关了，还挺快。。。每次不用win了就保存虚拟机状态。再开连win的开机时间都省了，挺快的。

    还有一个好处，windows会越用越慢。装好windows、软件后把虚拟硬盘备份，系统慢了，把备份的硬盘拉回来覆盖一下，比ghost什么的的装系统快多了:sunglasses:
    0_1516690908269_zzz.png

  • R
    副教授

    @bestucan

    @quotation
    People sometimes ask me if it is a sin in the Church of Emacs to use
    vi. Using a free version of vi is not a sin; it is a penance. So happy
    hacking.
    @author Richard Stallman
    @end quotation

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