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    如何直接在linux下安装of

    OpenFOAM
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    • 韬
      韬智tz 最后由 编辑

      大佬们有没有人知道在不能联网的工作站上怎么安装OpenFOAM，工作站是linux系统。。

      S X 2 条回复 最后回复 回复 引用
      • 李东岳
        李东岳 管理员 最后由 编辑

        https://www.cfd-china.com/topic/1908

        CFD高性能服务器 http://dyfluid.com/servers.html

        1 条回复 最后回复 回复 引用
        • S
          shrine @韬智tz 最后由 编辑

          @韬智tz 什么系统？我们单位的Redhat折腾了两月才好，最后还是交给运维

          韬 2 条回复 最后回复 回复 引用
          • 韬
            韬智tz @shrine 最后由 编辑

            @shrine linux系统呀

            1 条回复 最后回复 回复 引用
            • X
              xpqiu 教授 @韬智tz 最后由 编辑

              @韬智tz
              联网的目的无非是可以在线从更新源补充一些缺少的包，从而不需要手动去解决依赖问题。有一个办法是把你的系统的安装文件（一般是 ISO 文件）拿过来，做成一个本地更新源，然后就不联网也可以用类似 apt 或者 yum 这样的包管理器来补充依赖了。

              1 条回复 最后回复 回复 引用
              • 韬
                韬智tz @shrine 最后由 编辑

                @shrine 我们也是redhat，主要是现在找不到可以联网的这个系统下载预安装包，还没有装上，请问您单位是怎么解决的。

                Number44 1 条回复 最后回复 回复 引用
                • Number44
                  Number44 @韬智tz 最后由 编辑

                  @韬智tz 为什么不直接源码编译呢。源码包的下载地址在Allwmake文件里面都有，下载下来，改一下路径就好了。
                  因为一些特殊原因，我都是源码编译安装的，从来不需求联网。

                  算不准，发个散，报error，没问题！

                  韬 1 条回复 最后回复 回复 引用
                  • 韬
                    韬智tz @Number44 最后由 编辑

                    @number44大佬不会源码编译呀，能教我一下吗！！！

                    韬 Number44 2 条回复 最后回复 回复 引用
                    • 韬
                      韬智tz @韬智tz 最后由 编辑

                      @韬智tz 就比如下载地址在Allwmake文件的那一行，我要在Redhat上装的话怎么改路径。除了这些，还需要其他操作吗

                      1 条回复 最后回复 回复 引用
                      • Number44
                        Number44 @韬智tz 最后由 Number44 编辑

                        @韬智tz 我简单说一下吧。后续有需要我有空可以写个详细的教程。

                        1. 检查集群/工作站的GCC、MPI版本以及路径；
                        2. 下载解压两个源码包OpenFOAM和Thirdparty；
                        3. 修改etc/bashrc和etc/config/mpi的mpi设置；
                        4. 在Thirdparty/Allwmake里面关掉不必要/安装失败的库，例如MPI和CGAL（CGAL我长期装不上，不过这个库就一个我用不上的功能才会用到，关掉没所谓。）
                          建议MPI单独安装，方便以后多版本共存复用。
                        5. 编译Thirdparty，确保MPI和Scotch/metis装上了。
                        6. 编译OpenFOAM本体，不装CGAL会有个库装不上，也一样关掉不编译就好，除非你要用那个库。
                        7. 不要怕报错，学会看报错信息，慢慢改。

                        （难道大家都不用源码编译的吗？！！！:135: ）

                        算不准，发个散，报error，没问题！

                        韬 1 条回复 最后回复 回复 引用
                        • 韬
                          韬智tz @Number44 最后由 编辑

                          @number44 坐等

                          Number44 1 条回复 最后回复 回复 引用
                          • Number44
                            Number44 @韬智tz 最后由 编辑

                            @韬智tz
                            /----------------------分割线-------------------------/

                            1. 前言
                              适用场景：物理脱网工作站/集群，没root权限等场合。
                              脚本环境：sh
                              需要权限：无
                              测试环境：Windows WSL2 Ubuntu20.04/计算集群
                              OpenFOAM版本：OpenFOAM v6/v9
                              一点小说明：源码编译报错很正常！不要慌！都是技术性调整！ 调整心态，学会处理一些简单的编译错误，一般Bing/Google都能解决。这一点非常重要。不同的安装环境会出现五花八门的错误，淡定。
                              前排提示：个人水平有限，以下文档肯定一定会有错以及不适合的地方，发现了再改，其余自行斟酌。

                            2. 准备工作——GCC/MPI/Cmake
                              这三个安装过程略过，下载tar.gz看README。
                              安装前务必检查GCC版本是否适配，特别是安装OpenFOAM-extend，部分编译问题是版本的问题。
                              2.1 MPI
                              OpenFOAM提供丰富的MPI支持，一般使用OpenMPI和MPICH。
                              对于集群使用者（非root），如果集群提供MPI，使用集群MPI，只需要确定MPI的类型和路径：which mpicc
                              对于工作站使用者，在此强烈建议单独编译安装MPI，不要在Thirdparty中编译安装，方便多版本复用。
                              在此，以path_to_mpi代表MPI路径。
                              在你喜欢的位置新建一个sh脚本文件，把MPI路径和OpenFOAM的source命令写进去，例如：

                            echo Loading OpenFOAM9 env
export PATH=/home/otocolobus/software/mpich3.4.3-gcc9.4.0/bin:$PATH

export MPI_ROOT=/home/otocolobus/software/mpich3.4.3-gcc9.4.0
export MPI_ARCH_FLAGS="-DOMPI_SKIP_MPICXX"
export MPI_ARCH_INC="-isystem $MPI_ROOT/include"
export MPI_ARCH_LIBS="-L$MPI_ROOT/lib -lmpi"

source $HOME/OpenFOAM/OpenFOAM-9/etc/bashrc

                            然后再在根目录的.bashrc文件alias一个命令source这个文件，例如：

                            alias of9='source $HOME/of9.sh'
                            1. 编译参数设置
                              OpenFOAM及Thirdparty的编译参数设置由etc下的文件控制，编译规则由wmake/rules控制。一般只要修改etc下的参数，部分集群可能需要修改编译规则。
                              3.1 etc/bashrc
                              修改WM_MPLIB的值，SYSTEMOPENMPI会自动检索系统上的OpenMPI参数（用得少，可能有误），MPICH需要修改etc/config.sh/mpi中的参数，SYSTEMMPI是调用系统中的其他MPI，一般集群管理员会知道怎么处理。其他MPI没用过，就不说了。
                              3.2 etc/config.sh/mpi
                              config.sh是OpenFOAM调用的设置，包括编译器、scotch、paraview、mpi等。
                              对于MPICH，找到MPICH)，修改MPI_HOME和MPI_ARCH_PATH的值为path_to_mpi，例如
                            MPICH)
    export FOAM_MPI=mpich2-1.1.1p1
    export MPI_HOME=/home/otocolobus/software/mpich3.4.3-gcc9.4.0
#$WM_THIRD_PARTY_DIR/$FOAM_MPI
    export MPI_ARCH_PATH=/home/otocolobus/software/mpich3.4.3-gcc9.4.0
#$WM_THIRD_PARTY_DIR/platforms/$WM_ARCH$WM_COMPILER/$FOAM_MPI
                            1. Thirdparty编译
                              Thirdparty是OpenFOAM可能用到的第三方库，但并不是所以都是必须的。
                              在此建议：
                              a) 只安装Scotch/Metis。
                              b) GCC和MPI单独处理
                              c) CGAL装不上就别装了。不装就把foamHexMesh的Allwmake全部注释掉。（不知道在哪里？报错的时候就知道了）
                              d) paraView的依赖包比较多，别装了，计算集群打不开，工作站就导出数据换个地方处理。
                              在Thirdparty目录下，运行Allwmake脚本编译安装
                            ./Allwmake -j 4 >log.allwmake.log

                            正常编译完再运行一次Allwmake脚本可以看的第三方库的安装情况，例如

                            ========================================
Start ThirdParty Allwmake
========================================

========================================
Build MPI libraries if required

    have MPICH shared library (mpich2-1.1.1p1)


========================================
Build Scotch decomposition library scotch_6.0.9
    /home/otocolobus/OpenFOAM/ThirdParty-9/platforms/linux64GccDPInt32/scotch_6.0.9
    scotch header in /home/otocolobus/OpenFOAM/ThirdParty-9/platforms/linux64GccDPInt32/scotch_6.0.9/include    scotch libs   in /home/otocolobus/OpenFOAM/ThirdParty-9/platforms/linux64GccDPInt32/lib

========================================
Build PTScotch decomposition library scotch_6.0.9 (uses MPI)
    /home/otocolobus/OpenFOAM/ThirdParty-9/platforms/linux64GccDPInt32/scotch_6.0.9

    ptscotch header in /home/otocolobus/OpenFOAM/ThirdParty-9/platforms/linux64GccDPInt32/scotch_6.0.9/include/mpich2-1.1.1p1
    ptscotch libs   in /home/otocolobus/OpenFOAM/ThirdParty-9/platforms/linux64GccDPInt32/lib/mpich2-1.1.1p1
========================================
Build Metis decomposition
    optional component Metis was not found

========================================
Done ThirdParty Allwmake
========================================
                            1. OpenFOAM编译
                              OpenFOAM目录下运行Allwmake脚本编译安装
                            ./Allwmake -j 4 >log.allwmake.log

                            正常编译完再运行一次Allwmake脚本也可以看到各个库的安装情况。

                            1. 测试
                              全都编译通过后，找个算例检查一下blockMesh、串行、并行等功能是否正常。计算集群可能还要关注一下并行效率是否合理。

                            Q&A：

                            1. 在WSL2 Ubuntu20.04下安装时提示scotch缺zlib库，装上zlib后顺利安装。

                            算不准，发个散，报error，没问题！

                            韬 M 2 条回复 最后回复 回复 引用
                            • 韬
                              韬智tz @Number44 最后由 编辑

                              @number44 感谢大神

                              1 条回复 最后回复 回复 引用
                              • M
                                MingfengWang @Number44 最后由 编辑

                                @Number44 大神，我按照你的方法装不上，能否联系您提供有偿帮助，非常感谢！

                                Number44 1 条回复 最后回复 回复 引用
                                • Number44
                                  Number44 @MingfengWang 最后由 编辑

                                  @MingfengWang 报什么错了？

                                  算不准，发个散，报error，没问题！

                                  M 1 条回复 最后回复 回复 引用
                                  • M
                                    MingfengWang @Number44 最后由 编辑

                                    @Number44 报的错是flex包没有安装，我找了管理员帮我安装了，现在已经整好了，谢谢🙏

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