超算节点计算报错

一颗橙子

一个之前使用过的求解器突然不能使用了，并显示如下错误：mpirun was unable to launch the specified application as it could not find an executable
随后在vnc上重新对该求解器进行编译（wclean wmake），编译成功后计算还是报错，报错内容同上。

部分求解器出现上述状况（编译成功，但是不能算），还有一部分求解器完全正常。

求助各位如何解决该问题。

一颗橙子

感觉不是求解器的问题。这是什么原因呢

bestucan

@一颗橙子在超算节点计算报错中说：

mpirun was unable to launch the specified application as it could not find an executable

先不带mpirun，看看能不能单线程运行。如果能，那就是mpirun上的问题。
如果不能，那就是软件没配置好，兴许编译好了但环境没配置好所以找不到

cccrrryyy

只在超算上报错么？自己的服务器或者电脑呢？

一颗橙子

@bestucan 谢谢您的回复，单核是可以计算的，但是mpirun就不行了

一颗橙子

@cccrrryyy 只在超算提交任务以后报错，不用mpirun单核计算的话是可以计算的

bestucan

可能是超算上有不只一个节点，所以节点间通过IP地址交流信息。
而linux系统里有一套“权限”和“环境变量”的继承规则。你加载 openfoam 环境变量的的那句应该是放在家目录的.bashrc了（就是source ~/OpenFOAM/etc/bashrc，大概是这句）

而 miprun 再通过IP调用其他节点的时候，这个网络通信的用户权限和环境变量，应该没有继承你的用户名的环境变量；而是系统的环境变量。所以不包含你的用户目录下.bashrc里的东西。

把你家目录那句 source 放到 /etc/profile 试试。这是系统范围的环境变量。得是绝对路径：/home/<用户名>/OpenFOAM/……

当然也可能得在各个节点上都配上环境变量、装上 openfoam，这细致活得慢慢调……

部分求解器出现上述状况（编译成功，但是不能算），还有一部分求解器完全正常。

没用过多节点的，但问题是出在环境变量上没跑了。
到这个路径下
~/OpenFOAM/OpenFOAM-8/platforms/linux64GccDPInt32Opt/bin
这都是可运行的二进制文件。

直接./<文件名>，比如
./icoFoam
就知道是没编译好还是环境变量没配置好了。