CFD中文网

    CFD中文网
    • 登录
    • 搜索
    • 最新

    编译自己的求解器遇到问题“undefined reference”

    OpenFOAM
    4
    25
    4326
    正在加载更多帖子
    • 从旧到新
    • 从新到旧
    • 最多赞同
    回复
    • 在新帖中回复
    登录后回复
    此主题已被删除。只有拥有主题管理权限的用户可以查看。
    • H
      huiCfd 最后由 编辑

      Hello,各位大神，

      我在编译自己一个求解器的过程中出现了如下的问题：提示说有用undefined reference.

      -lincompressibleTransportModels -lOpenFOAM -ldl  \
     -lm -o /home/hui/OpenFOAM/hui-v1906/platforms/linux64GccDPInt32Opt/bin/dynaPorousNetFoam
Make/linux64GccDPInt32Opt/dynaPorousNetFoam.o: In function `main':
dynaPorousNetFoam.C:(.text.startup+0x1408): undefined reference to `Foam::netPanel::~netPanel()'
dynaPorousNetFoam.C:(.text.startup+0x1f01): undefined reference to `Foam::netPanel::netPanel(Foam::dictionary const&)'
......
......
dynaPorousNetFoam.C:(.text.startup+0x68c5): undefined reference to `Foam::netPanel::~netPanel()'
collect2: error: ld returned 1 exit status
/opt/OpenFOAM/OpenFOAM-v1906/wmake/makefiles/general:140: recipe for target '/home/hui/OpenFOAM/hui-v1906/platforms/linux64GccDPInt32Opt/bin/dynaPorousNetFoam' failed
make: *** [/home/hui/OpenFOAM/hui-v1906/platforms/linux64GccDPInt32Opt/bin/dynaPorousNetFoam] Error 1

      下面说一下我编译的程序结构，我的dynaForousNetFoam 求解器是基于PisoFOAM 进行简单修改后编译的。这个新的求解器调用了我自己写的一个class创建了porousZones 对象，并利用相关的成员函数对U 方程进行修改。
      这个class 名是netpanel，并且这个类可以单独用wmake编译成功，结果如下：

      .
├── platforms
│   └── linux64GccDPInt32Opt
│       ├── bin
│       └── lib
│           └── netPanel.so
└── run

      我求解器中部分相关的代码:

      ...
netPanel porousZones(netDict);  // constrcut net panel
porousZones.updatePoroField(porosityField, mesh, structuralPositions,structuralElements);
//- write the porosity field
porosityField.write();
...
// add source term to  U equation
porousZones.addResistance(UEqn,nu,mesh,structuralPositions,structuralElements);
...

      下面是我在编译dynaForousNetFoam 时用的file 和options 文件。从option中可以看出我在编译dynaForousNetFoam的时候已经链接到我之前写的那个class了，但是编译还是不通过。
      File:

      dynaPorousNetFoam.C
EXE = $(FOAM_USER_APPBIN)/dynaPorousNetFoam

      Option:

      EXE_INC = \
    -I./Netpanels/lnInclude \
    -I$ (LIB_SRC)/finiteVolume/lnInclude \
    -I$(LIB_SRC)/meshTools/lnInclude \
    -I$(LIB_SRC)/sampling/lnInclude \
    -I$(LIB_SRC)/TurbulenceModels/turbulenceModels/lnInclude \
    -I$(LIB_SRC)/TurbulenceModels/incompressible/lnInclude \
    -I$(LIB_SRC)/transportModels \
    -I$(LIB_SRC)/transportModels/incompressible/singlePhaseTransportModel

EXE_LIBS = \
    -L$(FOAM_USER_LIBBIN)\ -lnetPanel \
    -lfiniteVolume \
    -lfvOptions \
    -lmeshTools \
    -lsampling \
    -lturbulenceModels \
    -lincompressibleTurbulenceModels \
    -lincompressibleTransportModels

      所以有没有大神能够帮忙指点一下？

      1 条回复 最后回复 回复 引用
      • Y
        yfclark 讲师 最后由 编辑

        （1）wclean清空所有的文件，再编译看看（2）你自己的Class编写有问题，自己查找（3）看样子是想添加源项，直接在方程中添加可否

        H 1 条回复 最后回复 回复 引用
        • H
          huiCfd @yfclark 最后由 编辑

          @yfclark

          1. wclean/ wmake 已经很多次了，每次都是自己写的class可以先编译成功，并生成netPanel.so 这个lib。但是dynaPorousNetFoam.C 就编译出现问题。
          2. 如果自己写的class有问题的话，是不应该在第一步编译的时候就会出现问题？
          3. 因为研究的对象不是充满整个计算域，只有特定的范围内的网格才有源项。 又因为研究对象有大变形，不同时间对应不同的网格，所以不能直接在方程中添加源项。
          4. 所以我自己写的class就是根据结构的空间位置，找出对应的网格，并在这些网格中添加源项。
          1 条回复 最后回复 回复 引用
          • Y
            yfclark 讲师 最后由 编辑

            编译过了只是说明你骗过了编译器不代表程序没有问题，你说的可以直接添加源项解决，通过访问mesh的cells或者face解决

            H 1 条回复 最后回复 回复 引用
            • H
              huiCfd @yfclark 最后由 编辑

              @yfclark 在 编译自己的求解器遇到问题“undefined reference” 中说：

              编译过了只是说明你骗过了编译器不代表程序没有问题，你说的可以直接添加源项解决，通过访问mesh的cells或者face解决

              那个netpanel的class的作用就是找到特定的mesh，并在cells决添加源项。

              1 条回复 最后回复 回复 引用
              • Y
                yfclark 讲师 最后由 李东岳 编辑

                试一下

                //create volfield as source term
//initial it as zero
//forAll（mesh，celli）
｛
        if condition  
　　　S[celli]=your value
｝

                自己琢磨一下

                H 1 条回复 最后回复 回复 引用
                • H
                  huiCfd @yfclark 最后由 编辑

                  @yfclark
                  这个function, 我已经写到我的class中了，但是问题是在编译求解器时遇到问题“undefined reference”

                  void Foam::netPanel::addResistance
        (
            fvVectorMatrix&         UEqn,
            const volScalarField&   nu,
            const fvMesh&           mesh_,
            const volVectorField&   structuralPositions,
            const volVectorField&   structuralElements
        )
        {
            const vectorField& centres(mesh_.C());
            forAll(structuralElements,Elementi)
            {
                dimensionedTensor d_(tensor::zero);
                dimensionedTensor f_(tensor::zero);
                transformCoeffs(D_,d_,structuralPositions,structuralElements[Elementi]);
                transformCoeffs(F_,f_,structuralPositions,structuralElements[Elementi]);
                tensor& dvalue = d_.value();
                tensor& fvalue = f_.value();
                const scalarField V = mesh_.V();
                vectorField& Usource = UEqn.source();
                const vectorField& U = UEqn.psi();
        
                forAll(centres, cellI)
                {
                    if(isInPorousZone(centres[cellI],structuralPositions,structuralElements[Elementi]))
                     {
                    tensor dragCoeff = nu[cellI]*dvalue + 0.5*mag(U[cellI])*fvalue;
                    Usource[cellI] -=V[cellI]*dragCoeff & (U[cellI] );
                     }
                }
            }
        
        }
                  1 条回复 最后回复 回复 引用
                  • Y
                    yfclark 讲师 最后由 编辑

                    老哥，你这么老实，你直接函数式编程不就行了嘛，非要写class

                    1 条回复 最后回复 回复 引用
                    • H
                      huiCfd 最后由 编辑

                      我在想是不是 我的这个option里买有格式错误。
                      我试过将

                      EXE_LIBS = \
    -L$(FOAM_USER_LIBBIN)\ -lnetPanel \

                      改为

                      EXE_LIBS = \
    -L$(FOAM_USER_LIBBIN) -lnetPanel \

                      结果感觉更错啦

                           -lm -o /home/hui/OpenFOAM/hui-v1906/platforms/linux64GccDPInt32Opt/bin/dynaPorousNetFoam
/usr/bin/ld: cannot find -lnetPanel
collect2: error: ld returned 1 exit status
/opt/OpenFOAM/OpenFOAM-v1906/wmake/makefiles/general:140: recipe for target '/home/hui/OpenFOAM/hui-v1906/platforms/linux64GccDPInt32Opt/bin/dynaPorousNetFoam' failed
make: *** [/home/hui/OpenFOAM/hui-v1906/platforms/linux64GccDPInt32Opt/bin/dynaPorousNetFoam] Error 1
                      1 条回复 最后回复 回复 引用
                      • 李东岳
                        李东岳 管理员 最后由 编辑

                        undefined reference可能出现在你的虚函数，具体什么问题不太清楚，检查下你的成员函数

                        CFD高性能服务器 http://dyfluid.com/servers.html
                        2023年，线下CFD课，预热一下 http://dyfluid.com/class.html

                        H 1 条回复 最后回复 回复 引用
                        • H
                          huiCfd @李东岳 最后由 编辑

                          @东岳 感谢东岳老师回复，我又看了一下错误提示，出现问题的都是我写的虚函数。

                          W 1 条回复 最后回复 回复 引用
                          • W
                            wwzhao 教授 @huiCfd 最后由 编辑

                            @huiCfd 构造函数和析构函数是不是忘记定义了？

                            H 1 条回复 最后回复 回复 引用
                            • H
                              huiCfd @wwzhao 最后由 编辑

                              @wwzhao 赵教授，这两个函数我记得定义了，

                                  // Constructors
       netPanel
       (
           const dictionary&        netDict
       );

    //- Destructor
    ~netPanel();

                              但是我有一点不太明白，为什么有的函数后面有一个const，有的没有。例如：
                              这个虚函数是void funname() const;

                              void addResistance
        (
            fvVectorMatrix&         UEqn,
            const volScalarField&   nu,
            const fvMesh&           mesh,
            const matrix&   structuralPositions,
            const matrix&   structuralElements
        )const;

                              而这个函数是 bool funname(); 就没有const了。

                                      bool isInPorousZone
        (
            const point             x,
            const volVectorField&   structuralPositions,
            const vector&           structuralElementi
        );

                              const 在括号里面我知道是可以保证传入的参数不变，但是在外边是啥意思啊？

                              H W 2 条回复 最后回复 回复 引用
                              • H
                                huiCfd @huiCfd 最后由 编辑

                                @huiCfd
                                这个函数后面的const 是用来保护类的成员数据不发生改变。

                                1 条回复 最后回复 回复 引用
                                • W
                                  wwzhao 教授 @huiCfd 最后由 编辑

                                  @huiCfd 你这个只是声明（declaration），有没有具体的定义（definition）？

                                  H 1 条回复 最后回复 回复 引用
                                  • H
                                    huiCfd @wwzhao 最后由 编辑

                                    @wwzhao
                                    定义也是有的。如下

                                    Foam::netPanel::netPanel
(
    const dictionary&        netDict
)
:   // initial components
    netDict_(netDict),
    porousPropertiesDict_(netDict_.subDict("porousProperties")),
    porosity_(readScalar(porousPropertiesDict_.lookup("porosity"))),
    thickness_(readScalar(porousPropertiesDict_.lookup("halfthickness")))
    // D_(readVector(porousPropertiesDict_.lookup("D"))),  // initial as zeros
    // F_(readVector(porousPropertiesDict_.lookup("D")))  // initial as zeros
{
    dimensionedVector D_(porousPropertiesDict_.lookup("D"));
    dimensionedVector F_(porousPropertiesDict_.lookup("F"));

}
                                    W 1 条回复 最后回复 回复 引用
                                    • W
                                      wwzhao 教授 @huiCfd 最后由 编辑

                                      @huiCfd 把 netPanel.so 重命名成 libnetPanel.so 试试呢？

                                      H 1 条回复 最后回复 回复 引用
                                      • H
                                        huiCfd @wwzhao 最后由 编辑

                                        @wwzhao 不行。。

                                        W 1 条回复 最后回复 回复 引用
                                        • W
                                          wwzhao 教授 @huiCfd 最后由 编辑

                                          @huiCfd $(FOAM_USER_LIBBIN) 后面的换行符去掉了吗？

                                          H 1 条回复 最后回复 回复 引用
                                          • H
                                            huiCfd @wwzhao 最后由 编辑

                                            @wwzhao 是的，去掉何不去掉都试过了，
                                            去掉后显示的错误是

                                             -lm -o /home/hui/OpenFOAM/hui-v1906/platforms/linux64GccDPInt32Opt/bin/dynaPorousNetFoam
/usr/bin/ld: cannot find -llibnetPanel
collect2: error: ld returned 1 exit status
/opt/OpenFOAM/OpenFOAM-v1906/wmake/makefiles/general:140: recipe for target '/home/hui/OpenFOAM/hui-v1906/platforms/linux64GccDPInt32Opt/bin/dynaPorousNetFoam' failed
make: *** [/home/hui/OpenFOAM/hui-v1906/platforms/linux64GccDPInt32Opt/bin/dynaPorousNetFoam] Error 1

                                            没去掉的话跟原来的错误一样，都是undefined reference

                                            W 1 条回复 最后回复 回复 引用
                                            • W
                                              wwzhao 教授 @huiCfd 最后由 编辑

                                              @huiCfd
                                              1、去掉$(FOAM_USER_LIBBIN)后的换行符，注意后面的 netPanel 前不要加lib

                                              EXE_LIBS = \
    -L$(FOAM_USER_LIBBIN) -lnetPanel \

                                              2、编译出来的 netPanel.so 文件重命名为 libnetPanel.so

                                              H 1 条回复 最后回复 回复 引用
                                              • H
                                                huiCfd @wwzhao 最后由 编辑

                                                @wwzhao
                                                成功了啊！ 非常感谢。。
                                                是不可以总结如下经验：

                                                1. 自己编写的类在编译时一定要以lib开头，
                                                2. 然后在编译主程序时，$(FOAM_USER_LIBBIN)后面不能有换行符，
                                                3. -l之后直接跟自己编译的东西但是要去掉lib
                                                H 1 条回复 最后回复 回复 引用
                                                • H
                                                  huiCfd @huiCfd 最后由 编辑

                                                  @huiCfd 可能这个适用于of1906

                                                  1 条回复 最后回复 回复 引用
                                                  • W
                                                    wwzhao 教授 最后由 编辑

                                                    说明一下：

                                                    1、换行符（\）不能随便用，必须用在行尾。如果用在行中间，那么换行符后面的内容都会被忽略，所以你加的 -lnetPanel 没用。

                                                    2、-lfoo 会找名为 libfoo.so 的库文件，-l:bar.so 则会找 bar.so 文件，这是 gcc 的链接规则。

                                                    H 1 条回复 最后回复 回复 引用
                                                    • H
                                                      huiCfd @wwzhao 最后由 编辑

                                                      @wwzhao 非常感谢指点迷津！

                                                      1 条回复 最后回复 回复 引用
                                                      • First post
                                                        Last post