编译自己的求解器遇到问题“undefined reference”

[huiCfd]

Hello,各位大神，

我在编译自己一个求解器的过程中出现了如下的问题：提示说有用undefined reference.

-lincompressibleTransportModels -lOpenFOAM -ldl  \
     -lm -o /home/hui/OpenFOAM/hui-v1906/platforms/linux64GccDPInt32Opt/bin/dynaPorousNetFoam
Make/linux64GccDPInt32Opt/dynaPorousNetFoam.o: In function `main':
dynaPorousNetFoam.C:(.text.startup+0x1408): undefined reference to `Foam::netPanel::~netPanel()'
dynaPorousNetFoam.C:(.text.startup+0x1f01): undefined reference to `Foam::netPanel::netPanel(Foam::dictionary const&)'
......
......
dynaPorousNetFoam.C:(.text.startup+0x68c5): undefined reference to `Foam::netPanel::~netPanel()'
collect2: error: ld returned 1 exit status
/opt/OpenFOAM/OpenFOAM-v1906/wmake/makefiles/general:140: recipe for target '/home/hui/OpenFOAM/hui-v1906/platforms/linux64GccDPInt32Opt/bin/dynaPorousNetFoam' failed
make: *** [/home/hui/OpenFOAM/hui-v1906/platforms/linux64GccDPInt32Opt/bin/dynaPorousNetFoam] Error 1

下面说一下我编译的程序结构，我的dynaForousNetFoam 求解器是基于PisoFOAM 进行简单修改后编译的。这个新的求解器调用了我自己写的一个class创建了porousZones 对象，并利用相关的成员函数对U 方程进行修改。
这个class 名是netpanel，并且这个类可以单独用wmake编译成功，结果如下：

.
├── platforms
│   └── linux64GccDPInt32Opt
│       ├── bin
│       └── lib
│           └── netPanel.so
└── run

我求解器中部分相关的代码:

...
netPanel porousZones(netDict);  // constrcut net panel
porousZones.updatePoroField(porosityField, mesh, structuralPositions,structuralElements);
//- write the porosity field
porosityField.write();
...
// add source term to  U equation
porousZones.addResistance(UEqn,nu,mesh,structuralPositions,structuralElements);
...

下面是我在编译dynaForousNetFoam 时用的file 和options 文件。从option中可以看出我在编译dynaForousNetFoam的时候已经链接到我之前写的那个class了，但是编译还是不通过。
File:

dynaPorousNetFoam.C
EXE = $(FOAM_USER_APPBIN)/dynaPorousNetFoam

Option:

EXE_INC = \
    -I./Netpanels/lnInclude \
    -I$ (LIB_SRC)/finiteVolume/lnInclude \
    -I$(LIB_SRC)/meshTools/lnInclude \
    -I$(LIB_SRC)/sampling/lnInclude \
    -I$(LIB_SRC)/TurbulenceModels/turbulenceModels/lnInclude \
    -I$(LIB_SRC)/TurbulenceModels/incompressible/lnInclude \
    -I$(LIB_SRC)/transportModels \
    -I$(LIB_SRC)/transportModels/incompressible/singlePhaseTransportModel

EXE_LIBS = \
    -L$(FOAM_USER_LIBBIN)\ -lnetPanel \
    -lfiniteVolume \
    -lfvOptions \
    -lmeshTools \
    -lsampling \
    -lturbulenceModels \
    -lincompressibleTurbulenceModels \
    -lincompressibleTransportModels

所以有没有大神能够帮忙指点一下？

[yfclark]

（1）wclean清空所有的文件，再编译看看（2）你自己的Class编写有问题，自己查找（3）看样子是想添加源项，直接在方程中添加可否

[huiCfd]

@yfclark

1. wclean/ wmake 已经很多次了，每次都是自己写的class可以先编译成功，并生成netPanel.so 这个lib。但是dynaPorousNetFoam.C 就编译出现问题。
2. 如果自己写的class有问题的话，是不应该在第一步编译的时候就会出现问题？
3. 因为研究的对象不是充满整个计算域，只有特定的范围内的网格才有源项。 又因为研究对象有大变形，不同时间对应不同的网格，所以不能直接在方程中添加源项。
4. 所以我自己写的class就是根据结构的空间位置，找出对应的网格，并在这些网格中添加源项。

[yfclark]

编译过了只是说明你骗过了编译器不代表程序没有问题，你说的可以直接添加源项解决，通过访问mesh的cells或者face解决

[huiCfd]

@yfclark 在 编译自己的求解器遇到问题“undefined reference” 中说：

编译过了只是说明你骗过了编译器不代表程序没有问题，你说的可以直接添加源项解决，通过访问mesh的cells或者face解决

那个netpanel的class的作用就是找到特定的mesh，并在cells决添加源项。

[yfclark]

试一下

//create volfield as source term
//initial it as zero
//forAll（mesh，celli）
｛
        if condition  
　　　S[celli]=your value
｝

自己琢磨一下

[huiCfd]

@yfclark
这个function, 我已经写到我的class中了，但是问题是在编译求解器时遇到问题“undefined reference”

void Foam::netPanel::addResistance
        (
            fvVectorMatrix&         UEqn,
            const volScalarField&   nu,
            const fvMesh&           mesh_,
            const volVectorField&   structuralPositions,
            const volVectorField&   structuralElements
        )
        {
            const vectorField& centres(mesh_.C());
            forAll(structuralElements,Elementi)
            {
                dimensionedTensor d_(tensor::zero);
                dimensionedTensor f_(tensor::zero);
                transformCoeffs(D_,d_,structuralPositions,structuralElements[Elementi]);
                transformCoeffs(F_,f_,structuralPositions,structuralElements[Elementi]);
                tensor& dvalue = d_.value();
                tensor& fvalue = f_.value();
                const scalarField V = mesh_.V();
                vectorField& Usource = UEqn.source();
                const vectorField& U = UEqn.psi();
        
                forAll(centres, cellI)
                {
                    if(isInPorousZone(centres[cellI],structuralPositions,structuralElements[Elementi]))
                     {
                    tensor dragCoeff = nu[cellI]*dvalue + 0.5*mag(U[cellI])*fvalue;
                    Usource[cellI] -=V[cellI]*dragCoeff & (U[cellI] );
                     }
                }
            }
        
        }

[yfclark]

老哥，你这么老实，你直接函数式编程不就行了嘛，非要写class

[huiCfd]

我在想是不是 我的这个option里买有格式错误。
我试过将

EXE_LIBS = \
    -L$(FOAM_USER_LIBBIN)\ -lnetPanel \

改为

EXE_LIBS = \
    -L$(FOAM_USER_LIBBIN) -lnetPanel \

结果感觉更错啦

     -lm -o /home/hui/OpenFOAM/hui-v1906/platforms/linux64GccDPInt32Opt/bin/dynaPorousNetFoam
/usr/bin/ld: cannot find -lnetPanel
collect2: error: ld returned 1 exit status
/opt/OpenFOAM/OpenFOAM-v1906/wmake/makefiles/general:140: recipe for target '/home/hui/OpenFOAM/hui-v1906/platforms/linux64GccDPInt32Opt/bin/dynaPorousNetFoam' failed
make: *** [/home/hui/OpenFOAM/hui-v1906/platforms/linux64GccDPInt32Opt/bin/dynaPorousNetFoam] Error 1

[李东岳]

undefined reference可能出现在你的虚函数，具体什么问题不太清楚，检查下你的成员函数

[huiCfd]

@东岳 感谢东岳老师回复，我又看了一下错误提示，出现问题的都是我写的虚函数。

[wwzhao]

@huiCfd 构造函数和析构函数是不是忘记定义了？

[huiCfd]

@wwzhao 赵教授，这两个函数我记得定义了，

    // Constructors
       netPanel
       (
           const dictionary&        netDict
       );

    //- Destructor
    ~netPanel();

但是我有一点不太明白，为什么有的函数后面有一个const，有的没有。例如：
这个虚函数是void funname() const;

void addResistance
        (
            fvVectorMatrix&         UEqn,
            const volScalarField&   nu,
            const fvMesh&           mesh,
            const matrix&   structuralPositions,
            const matrix&   structuralElements
        )const;

而这个函数是 bool funname(); 就没有const了。

        bool isInPorousZone
        (
            const point             x,
            const volVectorField&   structuralPositions,
            const vector&           structuralElementi
        );        

const 在括号里面我知道是可以保证传入的参数不变，但是在外边是啥意思啊？

[huiCfd]

@huiCfd
这个函数后面的const 是用来保护类的成员数据不发生改变。

[wwzhao]

@huiCfd 你这个只是声明（declaration），有没有具体的定义（definition）？

[huiCfd]

@wwzhao
定义也是有的。如下

Foam::netPanel::netPanel
(
    const dictionary&        netDict
)
:   // initial components
    netDict_(netDict),
    porousPropertiesDict_(netDict_.subDict("porousProperties")),
    porosity_(readScalar(porousPropertiesDict_.lookup("porosity"))),
    thickness_(readScalar(porousPropertiesDict_.lookup("halfthickness")))
    // D_(readVector(porousPropertiesDict_.lookup("D"))),  // initial as zeros
    // F_(readVector(porousPropertiesDict_.lookup("D")))  // initial as zeros
{
    dimensionedVector D_(porousPropertiesDict_.lookup("D"));
    dimensionedVector F_(porousPropertiesDict_.lookup("F"));

}

[wwzhao]

@huiCfd 把 netPanel.so 重命名成 libnetPanel.so 试试呢？

[huiCfd]

@wwzhao 不行。。

[wwzhao]

@huiCfd $(FOAM_USER_LIBBIN) 后面的换行符去掉了吗？

[huiCfd]

@wwzhao 是的，去掉何不去掉都试过了，
去掉后显示的错误是

 -lm -o /home/hui/OpenFOAM/hui-v1906/platforms/linux64GccDPInt32Opt/bin/dynaPorousNetFoam
/usr/bin/ld: cannot find -llibnetPanel
collect2: error: ld returned 1 exit status
/opt/OpenFOAM/OpenFOAM-v1906/wmake/makefiles/general:140: recipe for target '/home/hui/OpenFOAM/hui-v1906/platforms/linux64GccDPInt32Opt/bin/dynaPorousNetFoam' failed
make: *** [/home/hui/OpenFOAM/hui-v1906/platforms/linux64GccDPInt32Opt/bin/dynaPorousNetFoam] Error 1

没去掉的话跟原来的错误一样，都是undefined reference