OpenFOAM在不同的系统下运行效率不一样？
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之前一直用的是工作站预装的ubuntu 16.04，OpenFOAM version 6. 之前的系统有些不太稳定，于是重新装了18.04，把所有东西都重新装了。今天重新运行了一个几乎一样的算例，发现计算速度显著变慢，solver也是我自己写的，都是一样的。计算时间来说，18.04是16.04的大概三倍。 请问有遇到类似的问题的吗？还是我装系统没有装好？
还有一个可能比较重要的方面就是我感觉18.04系统下对机械硬盘的读写显著变慢，可能因为系统不是预装的？我在装系统的时候为了保存数据，把机械硬盘拆下去了，只留固态硬盘，后来挂载的时候也出现了一些问题（主要是权限方面的，不知如何解决）。
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@CFDngu 在 OpenFOAM在不同的系统下运行效率不一样？ 中说：
之前一直用的是工作站预装的ubuntu 16.04，OpenFOAM version 6. 之前的系统有些不太稳定，于是重新装了18.04，把所有东西都重新装了。今天重新运行了一个几乎一样的算例，发现计算速度显著变慢，solver也是我自己写的，都是一样的。计算时间来说，18.04是16.04的大概三倍。 请问有遇到类似的问题的吗？还是我装系统没有装好？
还有一个可能比较重要的方面就是我感觉18.04系统下对机械硬盘的读写显著变慢，可能因为系统不是预装的？我在装系统的时候为了保存数据，把机械硬盘拆下去了，只留固态硬盘，后来挂载的时候也出现了一些问题（主要是权限方面的，不知如何解决）。
哦对了，算例位于机械硬盘中。
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@东岳
感觉。。。。。。。。
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@东岳 在 OpenFOAM在不同的系统下运行效率不一样？ 中说：
@CFDngu 在 OpenFOAM在不同的系统下运行效率不一样？ 中说：
18.04系统下对机械硬盘的读写显著变慢
这是怎么发现的？
确认了一下，同样的算例，之前计算时长至少差2倍，我提取了两个算例的自适应时间步长，是一样的。
难道真是系统的问题？
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@CFDngu 可能是挂载的读写速度比较慢。安装好再挂上的硬盘，对于linux系统跟挂U盘没什么区别。还能弹出。
挂载命令mount为了兼容各种文件格式NTFS（windows）、ext3、ext4（linux）还有mac的格式，要多走一道程序，如果格式不同会很明显的慢。
就好比系统自己的数据传输可以直接走硬件总线过而不过CPU。挂载上的要过CPU，格式不同就转以下，格式相同就算了，但也得走这一道程序，毕竟经过mount软件，而且处于随时可以umount的状态。这速度可不就下降了。
以上都是猜的，以下也是猜的解决方法。blkid命令能看文件系统和UUID。如果文件系统不同，慢点就很正常了。如果相同。在/etc/fstab里有系统启动时加载的硬盘及文件系统。把硬盘写进去可能大概也许有用？
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@bestucan 在 OpenFOAM在不同的系统下运行效率不一样？ 中说：
@CFDngu 可能是挂载的读写速度比较慢。安装好再挂上的硬盘，对于linux系统跟挂U盘没什么区别。还能弹出。
挂载命令mount为了兼容各种文件格式NTFS（windows）、ext3、ext4（linux）还有mac的格式，要多走一道程序，如果格式不同会很明显的慢。
就好比系统自己的数据传输可以直接走硬件总线过而不过CPU。挂载上的要过CPU，格式不同就转以下，格式相同就算了，但也得走这一道程序，毕竟经过mount软件，而且处于随时可以umount的状态。这速度可不就下降了。
以上都是猜的，以下也是猜的解决方法。blkid命令能看文件系统和UUID。如果文件系统不同，慢点就很正常了。如果相同。在/etc/fstab里有系统启动时加载的硬盘及文件系统。把硬盘写进去可能大概也许有用？
感谢回复，你说的挂载的步骤我都做过了。关于你的描述，我在想是否可能是这样：我在装18.04系统的时候把两块机械硬盘拆下来了（为了保存算例和数据），而16.04是出厂预装的，装系统的时候硬盘在里面，这样的存在方式可能和后挂载的有区别？
那么如果我格式化硬盘会有效果吗？
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@CFDngu 我能想到的区别就是fstab的区别了。
就算装系统的时候硬盘在里面，也可以选择不格式化，不过那样系统就记住这个盘，写到fstab里了。其他的区别还想不出来。 -
@bestucan 在 OpenFOAM在不同的系统下运行效率不一样？ 中说：
@CFDngu 我能想到的区别就是fstab的区别了。
就算装系统的时候硬盘在里面，也可以选择不格式化，不过那样系统就记住这个盘，写到fstab里了。其他的区别还想不出来。fstab里面我添加了内容，否则每次开机都要手动挂载了。。。。。
我也不知道这是怎么回事，难道真是系统的问题？ -
@CFDngu 估计是没弄对，如果要手动挂载，那硬盘一直处于可以随时被umount的状态，访问一直得过一道。
fstab我就改写过一次，倒是开机自识别，但是没测过速度。
看看怎么让系统把盘开机自挂载，把盘当成自己的一部分 -
@bestucan 明白你的意思了，我看了一下硬盘，现在确实还是处于可以随时被unmount的状态，最理想的情况应该是不能被随时卸载的对吧？
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@CFDngu 我猜的，试试，总比再重装好点,,,,，(◔‿◔)
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