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有关CFDEM安装

  • 李东岳
    管理员

    有没有CFDEM的简单的安装方法？之前官网那个照着做了几次。CFDEM倒是安装上了，和OpenFOAM一直没耦合起来。也忘了具体什么原因了。过几天有空再试试。:)

  • 散漫守望2016
    副教授

    东岳兄，我已经邮箱你一份了，我最近有点忙，之后会整理一份。你先试试安装。

    李东岳 S N 3 Replies
  • 李东岳
    管理员

    @散漫守望2016 刚回来，还没地方安置电脑，等我有了办公室我安装一下。

  • K

    @散漫守望2016 ，您好，我最近也在学习用CFDEM做模拟分析，关于它的安装方法，麻烦您能不能给而我发一份，我的邮箱是：kang_bo@126.com，而且目前CFDEM目前支持OpenFoam 3.x，请问您在4.0以上版本编译过吗，我的总是提示不支持这个版本，十分感谢。

  • R
    副教授

    官方的安装指南通常来说是最详细的。

    我自己试着安装了一下这种需要联合编译的软件，这不是一个成功的安装日志只是记录一下自己的遇到的问题。

    • linux 服务器：

    LSB Version: :base-4.0-amd64:base-4.0-noarch:core-4.0-amd64:core-4.0-noarch:graphics-4.0-amd64:graphics-4.0-noarch:printing-4.0-amd64:printing-4.0-noarch
    Distributor ID: CentOS
    Description: CentOS release 6.4 (Final)
    Release: 6.4
    Codename: Final

    • OpenFOAM
      预安装，module load 加载，版本： openfoam/3.0.1
    • 无root权限

    这个安装网页，没有提到其它的依赖库，似乎只要有O.F. 相应的版本就可以了。

    下面我一步步来尝试安装。

    1. 首先加载OpenFOAM
    2. 通过git 下载 LIGGGHTS
    $ cd
$ mkdir LIGGGHTS
$ cd LIGGGHTS 
$ git clone git://github.com/CFDEMproject/LIGGGHTS-PUBLIC.git LIGGGHTS-PUBLIC

    同样安装 CFDEM(R)

    $ cd
$ mkdir LIGGGHTS
$ cd LIGGGHTS 
$ git clone git://github.com/CFDEMproject/LIGGGHTS-PUBLIC.git LIGGGHTS-PUBLIC
$ git clone git://github.com/CFDEMproject/CFDEMcoupling-PUBLIC.git CFDEMcoupling-PUBLIC-$WM_PROJECT_VERSION

    获取库中最新文件

    cd $HOME/CFDEM/CFDEMcoupling-PUBLIC-$WM_PROJECT_VERSION
git stash  //小心这个操作会擦出本地修改的代码
git pull

    设置环境变量：

    $ cd
$ emacs .bashrc

    在.bashrc中写入

    #================================================#                                                                                                                                               
#- source cfdem env vars                                                                                                                                                                         
export CFDEM_VERSION=PUBLIC
export CFDEM_PROJECT_DIR=$HOME/CFDEM/CFDEMcoupling-$CFDEM_VERSION-$WM_PROJECT_VERSION
export CFDEM_SRC_DIR=$CFDEM_PROJECT_DIR/src
export CFDEM_SOLVER_DIR=$CFDEM_PROJECT_DIR/applications/solvers
export CFDEM_DOC_DIR=$CFDEM_PROJECT_DIR/doc
export CFDEM_UT_DIR=$CFDEM_PROJECT_DIR/applications/utilities
export CFDEM_TUT_DIR=$CFDEM_PROJECT_DIR/tutorials
export CFDEM_PROJECT_USER_DIR=$HOME/CFDEM/$LOGNAME-$CFDEM_VERSION-$WM_PROJECT_VERSION
export CFDEM_bashrc=$CFDEM_SRC_DIR/lagrangian/cfdemParticle/etc/bashrc
export CFDEM_LIGGGHTS_SRC_DIR=$HOME/LIGGGHTS/LIGGGHTS-PUBLIC/src
export CFDEM_LIGGGHTS_MAKEFILE_NAME=fedora_fpic
export CFDEM_LPP_DIR=$HOME/LIGGGHTS/mylpp/src
export CFDEM_PIZZA_DIR=$HOME/LIGGGHTS/PIZZA/gran_pizza_17Aug10/src
. $CFDEM_bashrc
#================================================#

    重新登录,信息提示：

    using default CFDEM_ADD_LIBS_DIR=/home/userID/CFDEM/CFDEMcoupling-PUBLIC-3.0.1/src/lagrangian/cfdemParticle/etc/addLibs_universal
using default CFDEM_ADD_LIBS_NAME=additionalLibs_3.0.1
!!! ERROR !!!: CFDEM_ADD_LIBS_DIR/CFDEM_ADD_LIBS_NAME=/home/userID/CFDEM/CFDEMcoupling-PUBLIC-3.0.1/src/lagrangian/cfdemParticle/etc/addLibs_universal/additionalLibs_3.0.1 does not exist.
make new dirs /home/userID/CFDEM/userID-PUBLIC-3.0.1 ? (y/n)

    检查安装：

    $CFDEM_PROJECT_DIR
$CFDEM_SRC_DIR
$CFDEM_LIGGGHTS_SRC_DIR

    出现三次：

    /home/userID/CFDEM/CFDEMcoupling-PUBLIC-3.0.1: is a directory

    检查pizza的地址？

    $ cd $CFDEM_SRC_DIR/lagrangian/cfdemParticle/etc/
$ sh cfdemSystemTest.sh

    检查结果

    
*********************************************
* C F D E M (R) c o u p l i n g             *
*                                           *
* by DCS Computing GmbH                     *
* www.dcs-computing.com                     *
*********************************************

*********************************
CFDEM(R)coupling system settings:
*********************************
CFDEM_VERSION=PUBLIC
couple to OF_VERSION=3.0.1
compile option=Opt

check if paths are set correctly
valid:yes critical:yes - $CFDEM_PROJECT_DIR = /home/userID/CFDEM/CFDEMcoupling-PUBLIC-3.0.1
valid:NO  critical:no - $CFDEM_PROJECT_USER_DIR = /home/userID/CFDEM/userID-PUBLIC-3.0.1 does not exist
valid:yes critical:yes - $CFDEM_SRC_DIR = /home/userID/CFDEM/CFDEMcoupling-PUBLIC-3.0.1/src
valid:yes critical:yes - $CFDEM_SOLVER_DIR = /home/userID/CFDEM/CFDEMcoupling-PUBLIC-3.0.1/applications/solvers
valid:yes critical:yes - $CFDEM_TUT_DIR = /home/userID/CFDEM/CFDEMcoupling-PUBLIC-3.0.1/tutorials
valid:yes critical:yes - $CFDEM_LIGGGHTS_SRC_DIR = /home/userID/LIGGGHTS/LIGGGHTS-PUBLIC/src
valid:NO  critical:yes - $CFDEM_LPP_DIR = /home/userID/LIGGGHTS/mylpp/src does not exist
valid:yes critical:yes - $CFDEM_ADD_LIBS_DIR = /home/userID/CFDEM/CFDEMcoupling-PUBLIC-3.0.1/src/lagrangian/cfdemParticle/etc/addLibs_universal
valid:NO  critical:no - $CFDEM_PIZZA_DIR = /home/userID/LIGGGHTS/PIZZA/gran_pizza_17Aug10/src does not exist
valid:NO  critical:no - $CFDEM_TEST_HARNESS_PATH = /home/userID/CFDEM/userID-PUBLIC-3.0.1/log/logFilesCFDEM-PUBLIC-3.0.1 does not exist
valid:NO  critical:no - $C3PO_SRC_DIR =  does not exist

library names
$CFDEM_LIGGGHTS_LIB_NAME = lmp_fedora_fpic
$CFDEM_LIB_NAME = lagrangianCFDEM-PUBLIC-3.0.1
$LD_LIBRARY_PATH  = /global/scratch/userID/OpenFOAM/userID-3.0.1/platforms/linux64IccDPInt32Opt/lib:/global/software/OpenFOAM-3.0.1/ThirdParty-3.0.1/platforms/linux64IccDPInt32Opt/lib/openmpi-system:/global/software/OpenFOAM-3.0.1/platforms/linux64IccDPInt32Opt/lib/openmpi-system:/global/software/OpenFOAM-3.0.1/ThirdParty-3.0.1/platforms/linux64IccDPInt32Opt/lib:/global/software/OpenFOAM-3.0.1/platforms/linux64IccDPInt32Opt/lib:/global/software/OpenFOAM-3.0.1/platforms/linux64IccDPInt32Opt/lib/dummy:/global/software/intel/composerxe/mkl/lib/intel64:/global/software/intel/composerxe/lib/intel64:/global/system/globus-5.2.5/lib64
$WM_NCOMPPROCS  = 
$WM_LABEL_SIZE = 32

Additional lib settings
.Makefile_vtk_tmp:1: /home/userID/CFDEM/CFDEMcoupling-PUBLIC-3.0.1/src/lagrangian/cfdemParticle/etc/addLibs_universal/additionalLibs_3.0.1: No such file or directory
make: *** No rule to make target `/home/userID/CFDEM/CFDEMcoupling-PUBLIC-3.0.1/src/lagrangian/cfdemParticle/etc/addLibs_universal/additionalLibs_3.0.1'.  Stop.

*******************
g++:
/usr/bin/g++
g++ (GCC) 4.4.7 20120313 (Red Hat 4.4.7-3)
Copyright (C) 2010 Free Software Foundation, Inc.
This is free software; see the source for copying conditions.  There is NO
warranty; not even for MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.

gcc:
/usr/bin/gcc
gcc (GCC) 4.4.7 20120313 (Red Hat 4.4.7-3)
Copyright (C) 2010 Free Software Foundation, Inc.
This is free software; see the source for copying conditions.  There is NO
warranty; not even for MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.

mpic++:
/global/software/openmpi-1.6.5/intel/bin/mpic++
icpc (ICC) 14.0.2 20140120
Copyright (C) 1985-2014 Intel Corporation.  All rights reserved.

mpirun:
/global/software/openmpi-1.6.5/intel/bin/mpirun
mpirun (Open MPI) 1.6.5

Report bugs to http://www.open-mpi.org/community/help/
**********************
additional packages...

    结果显示

    $CFDEM_PROJECT_USER_DIR
$CFDEM_PIZZA_DIR
$CFDEM_TEST_HARNESS_PATH
$C3PO_SRC_DIR

    不存在，不知道有什么影响？

    编译LIGGGHTS(R) and CFDEM(R)coupling:
    回到home：

    git clone git://github.com/CFDEMproject/CFDEMcoupling-PUBLIC.git CFDEMcoupling-PUBLIC-$WM_PROJECT_VERSION

    注意，这个git clone从手册中似乎不全，我是到他的rep查到的准确地址。

    编译LIGGGHTS(R)

    安装过程很快，但是我注意到有一个处有错误

    using CFDEM_LAMMPS_LIB_DIR=/home/userID/LIGGGHTS/LIGGGHTS-PUBLIC/src/../lib defined by user.
using CFDEM_ADD_LIBS_DIR=/home/userID/CFDEM/CFDEMcoupling-PUBLIC-3.0.1/src/lagrangian/cfdemParticle/etc/addLibs_universal defined by user.
using CFDEM_ADD_LIBS_NAME=additionalLibs_3.0.1 defined by user.
!!! ERROR !!!: CFDEM_ADD_LIBS_DIR/CFDEM_ADD_LIBS_NAME=/home/userID/CFDEM/CFDEMcoupling-PUBLIC-3.0.1/src/lagrangian/cfdemParticle/etc/addLibs_universal/additionalLibs_3.0.1 does not exist.

    有一个lib似乎不存在。

    接着编译CFDEM(R)coupling

    $ cd
$ cfdemCompCFDEM

    然后就出现了很多error，由于太多，我就不贴了，注意到几处细节：

    Please provide the utilities to be compiled in the /global/home/userID/CFDEM/CFDEMcoupling-PUBLIC-3.0.1/src/lagrangian/cfdemParticle/etc/utilities-list.txt file.
structure:
path  to provide the path relative to CFDEM_UT_DIR

example:
cfdemPostproc/dir

    似乎要编译的话，要在

    /global/home/userID/CFDEM/CFDEMcoupling-PUBLIC-3.0.1/src/lagrangian/cfdemParticle/etc/utilities-list.txt

    指定一些具体的求解器, 安装说明书到这里就没有多写了。这次不成功的安装也就到这吧。

  • K

    太感谢，您的分享了，我也遇到到了类似的问题，现在正在找原因，有什么发现咱们再一起讨论，太感谢了。

  • 赵

    @random_ran

    收下我的膝盖和腿毛

  • 李东岳
    管理员

    @killer_allan

    你好，请问 @random_ran 发的方法你是否自己操作过？我考虑从我的网站添加一个链接直接跳转到这里，让 @random_ran 的大作有更多人关注，:expressionless:

    R 1 Reply
  • R
    副教授

    @李东岳 千万别~那是不成功的安装，是我自己按照官方手册的说明书一步步走的，没有什么的。

    很多编译器的选择，mpi的选择， cmake的版本都很重要，然而我并没有彻底搞清楚，只是随手记录了一下当时的操作。如果能安装成功，并且跑出算例，或许才有让更多人看到的意义。

  • 赵

    @killer_allan
    Any feedback? :joking:

  • 李东岳
    管理员

    @killer_allan

    感谢反馈。由于内容版权问题，CFD中国不想牵涉到版权纠纷，很抱歉楼上的内容将随后被删除。不过我会尝试和大家一起写一个比较完整地安装过程，希望对你有帮助。

    @赵一铭 不知这周除了那个CFD界文章是否还有时间参考 @random_ran 的过程做一次安装尝试？你看你的时间安排，太近的话我自己装一下也可以 :cheeky:

  • K

    @李东岳 ，感谢东岳大哥及其他同仁的帮忙，这个安装过程还有有些问题，期待问题的解决，谢谢。

  • 李东岳
    管理员

    烦请感兴趣的人提供CFDEM在Ubuntu下的完整安装过程，净测试可行后，提供1000元赞助。

    X 1 Reply
  • X
    教授

    @李东岳 装好了吗？我最近在 CentOS 6.5 上装了最新的 CFDEM+LIGGGHTS，Ubuntu 上应该差不多，详细过程我没记录，但摸索一下应该能出来，如果还需要的话找我。

    李东岳 hurricane007 2 Replies
  • 李东岳
    管理员

    @xpqiu

    目前还需要。即Ubuntu16之后版本的详细安装记录。麻烦邱版主记录记录，事后提供报酬略表心意。

    X 1 Reply
  • X
    教授

    @李东岳 好，我抽时间弄一个 Ubuntu 来装一遍。

    李东岳 hurricane007 2 Replies
  • 李东岳
    管理员

    @xpqiu
    非常感谢！！

  • hurricane007

    @xpqiu 最近两天也在试着装CFDEM，碰到了几乎一样的错误。

    Please provide the libraries to be compiled in the /home/he/CFDEM/CFDEMcoupling-PUBLIC-3.0.1/src/lagrangian/cfdemParticle/etc/library-list.txt file.

    下面有几条

    Make/linux64GccDPInt32Opt/options:64: /home/he/CFDEM/CFDEMcoupling-PUBLIC-3.0.1/src/lagrangian/cfdemParticle/etc/addLibs_universal/additionalLibs_3.0.1: No such file or directory
make: *** No rule to make target '/home/he/CFDEM/CFDEMcoupling-PUBLIC-3.0.1/src/lagrangian/cfdemParticle/etc/addLibs_universal/additionalLibs_3.0.1'.  Stop.
Make/linux64GccDPInt32Opt/options:64: /home/he/CFDEM/CFDEMcoupling-PUBLIC-3.0.1/src/lagrangian/cfdemParticle/etc/addLibs_universal/additionalLibs_3.0.1: No such file or directory
make: *** No rule to make target '/home/he/CFDEM/CFDEMcoupling-PUBLIC-3.0.1/src/lagrangian/cfdemParticle/etc/addLibs_universal/additionalLibs_3.0.1'.  Stop.
wmake error: file 'Make/linux64GccDPInt32Opt/sourceFiles' could not be created in /home/he/CFDEM/CFDEMcoupling-PUBLIC-3.0.1/src/lagrangian/cfdemParticle
  • hurricane007

    @xpqiu 好了我装成功了。。我再换个系统测试一下，明天写个教程出来

    李东岳 MinZhang 2 Replies
  • 李东岳
    管理员

    @hurricane007
    恭喜！期待。
    装完了我找人测试下。

  • MinZhang

    @hurricane007 您好，新手跪求您的安装教程。万分感谢！！

    hurricane007 1 Reply
  • hurricane007

    @minzhang 我记得我好像有写给东岳大神，有点小报错但是能用。

    MinZhang 2 Replies
  • MinZhang

    @hurricane007 http://www.cfd-china.com/topic/971/cfdem-在一个新的ubuntu系统的安装-基本是官网教程就加了一点东西
    这个吗？

  • MinZhang

    @hurricane007 还是这个？
    http://www.cfd-china.com/topic/1037/cfdem安装测试

    hurricane007 1 Reply
  • hurricane007

    @minzhang 两个是一样的。BTW 你试试看能不能用，能用的话，东岳哥还欠我钱:chigua: :chigua: :chigua:

    MinZhang 1 Reply
  • MinZhang

    @hurricane007 嗯好，我如果测试了，我会在这里说一下结果的。

  • S

    @散漫守望2016 守望老师您好，我按照网上各种帖子安装CFDEM，但老是不能运行出算例结果，总有各种问题，想向您求一份CFDEM的安装秘籍，请您不吝赏赐：firemari@163.com。
    另外，还有一个问题想向您咨询，CFDEM是不是可以把OpenFOAM里的任意一个求解器与LIGGGHTS的颗粒体系进行耦合？

    散漫守望2016 1 Reply
  • 散漫守望2016
    副教授

    @shockm 你好，关于CFDEM的安装教程可以加一下这个qq群：109526446，群里有教程。
    此外，原则上来说，Liggghts可以和OpenFOAM上很多求解器来耦合，比如，你要是做液固流动，那么可以采用VOF的求解器和DEM耦合。但是比如你要做流化床内气固燃烧，那么涉及到了颗粒的形变反应，liggghts没法完成的，所以虽然有气相的燃烧求解器，还是没法完成整个工作。所以你可以详细说一下你要做什么，有什么需求，我可以给你一些建议。

    S A 2 Replies
  • S

    @散漫守望2016 守望老师您好，非常感谢您的回复！
    考虑可压气体超音速流动和稠密固体颗粒群的相互作用问题，考虑四向耦合，不考虑颗粒变形破碎。学习了您的相关帖子，但OpenFOAM自带DPMFoam是不可压的，所以想看看CFDEM能不能把sonicFoam和LIGGGHTS耦合来处理这个问题? 或有什么其他处理办法。

    李东岳 1 Reply
  • 李东岳
    管理员

    @shockm 我见过类似的问题，我倒是把DPMFoam做成过可压缩求解器，但是后来想了一下不如把rhoCentralFoam或者rhoPimpleFoam植入拉格朗日粒子的套路更简单一些。

    另外，咋俩之前联系过不？ 如果是的话，不好意思我最近事情特别多，尤其到暑假前。这个是一个非常系统的科研工作，经验来看不是2 3个月能出SCI的东西 :ok3: 需要严谨的当成一个1年的博后工作来做

    S 1 Reply
  • S

    @东岳 是的东岳老师，谢谢您的回复，要不您收我做1年博士后吧:xiexie:

    李东岳 1 Reply
  • 李东岳
    管理员

    @shockm 我对你这个问题非常感兴趣，不过我对很多东西都感兴趣，就是时间太少了哎。我也是没学生干只能自己干。现在真是旱的旱死涝的涝死。大组多的学生不知道干啥，刚进来的老师一个学生没有。要不要试试再申请一个面上？然后找一个学生来干，我可以提供思路指导。另一个能帮你的方式就是，我们作为合作单位申请明年3月份的，然后我这面可以负责你本子里面关于算法的东西（包括写和如何实施）。

    是的东岳老师，谢谢您的回复，要不您收我做1年博士后吧

    不行我这哪容得下您这大佛啊 :chitang:

  • A

    @散漫守望2016 守望老师，您好！在论坛中看了您关于气固两相流的许多见解，也下载了许多您的文章，收益良多。目前我是博一，用mPPICFoam耦合coalchemistryfoam做一些工业流化床的数值模拟。然而模拟结果始终不理想。主要问题是sand进入旋转分离器后随着高速气流飞出，而不是进行循环，并且颗粒速度明显偏高，看您文献中颗粒速度是＜2，我的模拟结果和都偏大，也考虑了可能是曳力系数亦或者是动量公式问题，由于能力有限，始终找不到问题所在。您若方便，若能指导指导或者给些建议，不胜感激。联系邮箱yang11415@163.com。

    散漫守望2016 1 Reply
  • N

    @散漫守望2016 前辈，您好能不能分享我一份cfdem的安装指导呢，谢谢，1053010027@qq.com

    散漫守望2016 1 Reply
  • 散漫守望2016
    副教授

    @nanxuan 你好，可以加入qq群：109526446，群里有比较详细的安装教程。

    N 1 Reply
  • 散漫守望2016
    副教授

    @Ant 你好，我最近比较忙，所以可能没时间给你帮助。我建议你可以先采用CFPD Barracuda这个软件尝试一下你要计算的装置。因为这个软件上手容易，操作简单，用的方法也是MPPIC，你看看用这个软件能否得到你想要的结果。如果还是速度大，说明你的装置结构有问题，比如riser出口到旋风分离器入口的horizontal channel太细了，或者是料腿太细了，或者旋风分离器的vortex finder太细了等，原因很多，因为没有看到你的装置和模拟，所以没法给你针对性的建议，抱歉。多调试看看，MPPIC是个蛮简单的方法。

    A 1 Reply
  • N

    @散漫守望2016
    好的，谢谢前辈[

  • A

    @散漫守望2016 多谢您的指导，用自己的foam算过软件自带的例子，结果和标准的例子结果比较吻合，应该不是程序的问题。根据您的分析，我觉得很可能还是我模型结构的问题。十分感谢。

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