Ubuntu18.04更新至20.04 OpenFOAM无法正常使用
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前一段时间看20.04LTS出来了，手痒就更新了，没想到没备份，更新了OpenFOAM无法正常使用。
输入blockMesh显示没有这个命令。
昨天尝试删除之后重新编译一下，编译之后依然不能使用。
求问各位大佬，该怎么破，重装吗？
（ps.之前尝试过重装，奈何双系统一直重装不上，重装=重装双系统，太麻烦了，几个月前刚做的系统……） -
开个贴主要还想说，openfoam V7代码从github迁移到gitee，速度上升许多倍，昨天尝试几秒就下下来了。
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然后还想附上一直想发出来的，之前安装三个版本的openfoam历程，欢迎大家修改完善
OpenFOAM安装
Overview
系统版本：Ubuntu18.04 LTS
安装方式：编译安装
安装版本：OpenFOAM-7、foam-extend 4.1、OpenFOAM-V1902
参阅：
多版本共存方式
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终端输入
gedit $HOME/.bashrc -
方法1
在文件的最底部重新取一行添加下述两行文字：
alias of3x="source ~/OpenFOAM/OpenFOAM-3.x/etc/bashrc" alias of4x="source ~/OpenFOAM/OpenFOAM-4.x/etc/bashrc" -
方法2
在文件的最底部添加：
# source $HOME/OpenFOAM/OpenFOAM-7/etc/bashrc source $HOME/foam/foam-extend-4.1/etc/bashrc # source $HOME/OpenFOAM/OpenFOAM-v1912/etc/bashrc -
方法3 (采用)
source $HOME/OpenFOAM/OpenFOAM-7/etc/bashrc alias of19='source $HOME/OpenFOAM/OpenFOAM-v1912/etc/bashrc' alias fe41='source $HOME/OpenFOAM/foam-extend-4.1/etc/bashrc'
OpenFOAM-7（大致耗时一下午5~6h）
安装of7
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确保ubuntu可以联网，启动终端，在终端输入（分三次输入，直接全部复制进去）：
# 更新软件 sudo apt update # 安装依赖1 sudo apt-get install build-essential flex bison git-core cmake zlib1g-dev libboost-system-dev libboost-thread-dev libopenmpi-dev openmpi-bin gnuplot libreadline-dev libncurses-dev libxt-dev # 安装依赖2 sudo apt-get install qt4-dev-tools libqt4-dev libqt4-opengl-dev freeglut3-dev libqtwebkit-dev -
下载OpenFOAM-7.tar以及ThirdParty-7.tar，然后从窗口进入到ubuntu系统的Home文件夹下建立文件夹为OpenFOAM。
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进入这个OpenFOAM文件夹，将下载的OpenFOAM-7.tar复制进去右键解压缩会出现一个OpenFOAM-7-master的文件夹。去掉master后缀改名为OpenFOAM-7。同样把ThirdParty-7.tar解压缩至此处，去掉master后缀改名为ThirdParty-7文件夹。注意，两个文件夹缺一不可。否则会提示缺少相关文件编译error。
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配置环境变量：在终端输入
gedit $HOME/.bashrc会打开一个文件，我们在文件的最底部重新取一行添加下述文字：
source $HOME/OpenFOAM/OpenFOAM-7/etc/bashrc保存并关闭。关闭终端并打开新的终端的时候，环境变量自动生效。
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配置并行编译
在OpenFOAM目录下的etc下打开bashrc文件，在其中最底部添加
export WM_NCOMPPROCS=4表示采用4核并行编译。用户可以随意更改其中的数字。
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编译OpenFOAM：打开终端，输入（即切换到OpenFOAM-7目录下）：
cd $HOME/OpenFOAM/OpenFOAM-7/然后输入：
./Allwmake这时候会输出大量的信息，编译开始。编译之后请尝试运行：
blockMesh/*---------------------------------------------------------------------------*\ ========= | \\ / F ield | OpenFOAM: The Open Source CFD Toolbox \\ / O peration | Website: https://openfoam.org \\ / A nd | Version: 7 \\/ M anipulation | \*---------------------------------------------------------------------------*/ Build : 7 Exec : blockMesh Date : Mar 20 2020 Time : 14:46:02 Host : "veen-zhou" PID : 12641 I/O : uncollated Case : /home/veen/OpenFOAM/OpenFOAM-7 nProcs : 1 sigFpe : Enabling floating point exception trapping (FOAM_SIGFPE). fileModificationChecking : Monitoring run-time modified files using timeStampMaster (fileModificationSkew 10) allowSystemOperations : Allowing user-supplied system call operations // * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * //
编译安装Paraview
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终端切换到ThirdParty-7目录下并键入：
sudo apt-get install qt5-default libqt5x11extras5-dev qttools5-dev curl -
终端键入：
./makeParaView其中会自动下载ParaView并开始编译，编译过程较长。编译完成后会显示Installation complete for paraview-5.4.0等信息。
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分四次键入
wmRefresh cd $FOAM_UTILITIES/postProcessing/graphics/PVReaders ./Allwclean ./Allwmake将会再次开始编译过程。几分钟即编译完成。然后键入paraFoam即可运行。
foam-extend 4.1
安装fe41
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确保Ubuntu可以联网
# 更新 sudo apt-get update # 安装依赖 sudo apt-get install git-core build-essential binutils-dev cmake flex \ zlib1g-dev qt4-dev-tools libqt4-dev libncurses5-dev curl bison \ libxt-dev rpm mercurial graphviz python python-dev python3 python3-dev然而这样并不能成功安装，继续安装一些依赖
sudo apt-get install openmpi-bin libopenmpi-dev #Addition: Use system installed OpenMPI sudo apt install curl #Addition: Needed for downloading of ThirdPartyProducts -
设置一下
echo "export WM_THIRD_PARTY_USE_BISON_27=1" > etc/prefs.sh #Compile bison-2.7 echo "export WM_MPLIB=SYSTEMOPENMPI" >> etc/prefs.sh #Addition: Use system installed OpenMPI echo "export OPENMPI_DIR=/usr" >> etc/prefs.sh #Addition: Use system installed OpenMPI echo "export OPENMPI_BIN_DIR=\$OPENMPI_DIR/bin" >> etc/prefs.sh #Addition: Use system installed OpenMPI See the etc/prefs-sh-EXAMPLE file for more examples on how to do modifications. source etc/bashrc echo "alias fe41='source \$HOME/foam/foam-extend-4.1/etc/bashrc'" >> $HOME/.bashrc -
编译(四核编译时间大概3~4小时)
./Allwmake.firstInstall -
测试安装
# Test the installation: # Press CTRL-ALT-T to open an new terminal window fe41 mkdir -p $FOAM_RUN run # 如果下一步没有成功请手动复制 cp -r $FOAM_TUTORIALS/incompressible/icoFoam/cavity cd cavity blockMesh
运行结果：
/*---------------------------------------------------------------------------*\ | ========= | | | \\ / F ield | foam-extend: Open Source CFD | | \\ / O peration | Version: 4.1 | | \\ / A nd | Web: http://www.foam-extend.org | | \\/ M anipulation | For copyright notice see file Copyright | \*---------------------------------------------------------------------------*/ Build : 4.1-93fffffdb745 Exec : blockMesh Date : Mar 20 2020 Time : 15:47:10 Host : "veen-zhou" PID : 13020 CtrlDict : "/home/veen/foam/foam-extend-4.1/FOAM_RUN/cavity/system/controlDict" Case : /home/veen/foam/foam-extend-4.1/FOAM_RUN/cavity nProcs : 1 sigFpe : Enabling floating point exception trapping (FOAM_SIGFPE). allowSystemOperations : Disallowing user-supplied system call operations // * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * //安装绿色Paraview
绿色版ParaView安装非常简单，并且在处理网格较多的算例比编译版本的paraFoam要快。用户可以在ParaView官方（或本链接 Paraview-5.8.0）直接下载linux版本的ParaView绿色版，随意解压缩到任意的文件夹，双击打开ParaView/bin/paraview文件即可运行（如下图）。在打开ParaView之后，在任意的OpenFOAM算例下创建一个空文件并命名为case.foam，然后用ParaView打开这个文件即可。
OpenFOAM-V1902
安装of19(编译时间2h)
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进行系统环境初始化
# 使用root账户 sudo -s # 更新 apt-get update # 安装依赖 apt-get install build-essential flex bison cmake zlib1g-dev libboost-system-dev libboost-thread-dev \ libopenmpi-dev openmpi-bin gnuplot libreadline-dev libncurses-dev libxt-dev \ qt5-default libqt5x11extras5-dev libqt5help5 qtdeclarative5-dev qttools5-dev \ libqtwebkit-dev freeglut3-dev libqt5opengl5-dev texinfo \ libscotch-dev libcgal-dev python python-dev # 退出root exit -
将下载的安装包解压到OpenFOAM/文件夹下
# 查看系统架构 uname -m # 对于64位系统 source $HOME/OpenFOAM/OpenFOAM-v1912/etc/bashrc WM_LABEL_SIZE=64 # 安装之后发现还是有如下错误： # No completion added for /home/veen/OpenFOAM/OpenFOAM- # v1912/platforms/linux64GccDPInt32Opt/bin... incorrect platform, or not yet compiled? # 解决方案： # 进行bashrc文件的修改 # 打开Home/OpenFOAM/OpenFOAM-v1912//etc/bashrc # 找到export WM_LABEL_SIZE=32 # 修改为WM_LABEL_SIZE=64 -
环境变量修改
echo "alias of1912='source \$HOME/OpenFOAM/OpenFOAM-v1912/etc/bashrc $FOAM_SETTINGS'" >> $HOME/.bashrc # 安装检查 foamSystemCheck -
继续修改（我也不记得自己改没改了）
cd $WM_PROJECT_DIR export QT_SELECT=qt5 -
进行编译
/Allwmake -j -s -q -l -
测试安装
# 打开terminal，键入 of1912 blockMesh出现如下信息即为安装成功
/*---------------------------------------------------------------------------*\ | ========= | | | \\ / F ield | OpenFOAM: The Open Source CFD Toolbox | | \\ / O peration | Version: v1912 | | \\ / A nd | Website: www.openfoam.com | | \\/ M anipulation | | \*---------------------------------------------------------------------------*/ Build : v1912 OPENFOAM=1912 patch=200316 Arch : "LSB;label=64;scalar=64" Exec : blockMesh Date : Mar 20 2020 Time : 18:40:47 Host : veen-zhou PID : 26190 I/O : uncollated Case : /home/veen/OpenFOAM/OpenFOAM-v1912/tutorials/incompressible/icoFoam/cavity/cavity nProcs : 1 trapFpe: Floating point exception trapping enabled (FOAM_SIGFPE). fileModificationChecking : Monitoring run-time modified files using timeStampMaster (fileModificationSkew 10) allowSystemOperations : Allowing user-supplied system call operations // * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * //
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编译的时候有木有错误信息啊，会不会是某些libraries版本不对了，ubuntu 20好像更新了不少东西
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@星星星星晴 开头有报代码有问题，最后报告有个头文件找不着。哪天再看看，不过李老师的Ubuntu20.04三个版本的都装上了。我估计有可能是我从18更新的原因……
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@veen 哈哈哈 更新就是蛋疼
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@veen
我好奇的问一下 为什么要用编译安装的方式呢？
国内apt-get 速度不好？ -
@星星星星晴 太难了 ，不过还好最近不用它……要用的时候再说吧，希望大佬们都更新成功，及时备份，别像我这样手痒更新了回不去。
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@星星星星晴 因为还要自己写求解器之类的，没试过apt-get，回头也可以试试。
求问大佬：三种openfoam都能apt-get吗？装好之后也和编译的一样？ -
@veen 我用起来没有其他感觉，可能是如果直接apt-get的话装在/opt里面，然后你就无法随便动了把，不过也有user_src啊什么的，我也不太了解 所以很好奇为什么都用编译的方式，直接安装不也很香么。。不过新版ubuntu 可能不能apt-get 4.1以前的版本，每个版本都有支持的系统的
建议你改一下ubuntu 的源，国内的源会快点，清华，阿里什么的 -
@星星星星晴 嗯嗯，好的，感谢！清华源是快，不过还是容易断…
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太长了
一般最好不要更新，难免出现各种不可预料的问题 -
@东岳 好的，谢谢李老师。今天早上破案了，OpenFOAM7成功编译了。
